在邓州市一初中院内，现已不存。尊经阁为文庙的一部分，明万历年间始建，崇祯年间重修。

万历八年(1580年)，晋江举人黄锡知邓州。黄锡服政清勤，遇事有担当，仗地均粮，亲历经界，虽穷乡必达，宿弊为之一清。迁学宫(文庙)于内城南门西侧(今城区一小处)，前增建石牌坊，后增建尊经阁。

乾隆版《邓州志》卷六载:“......万历八年，分守汝南道徐元气、知州黄锡，迁儒学于内城南门之西。乡官丁垓、丁铣捐居宅为学基。自大成殿至根星门，皆其地也。崇祯六年，知州董应奎、举人丁之栋重修尊经（阁）。明末虽残毁，而大规犹在。"